Η ερευνητική μου δραστηριότητα εντάσσεται στις εφαρμογές της υδροακουστικής τεχνολογίας στη θαλάσσια οικολογία, και στις μεθόδους υποβρύχιας παρατήρησης με ακουστικά και οπτικά μέσα. Εξειδικεύομαι στην αλιευτική υδροακουστική τεχνολογία (fisheries acoustics), στην υδροακουστική εκτίμηση ιχθυαποθέματος, στις τεχνικές προσομοίωσης και αποσφαλμάτωσης της αλιευτικής υδροακουστικής μέτρησης, και στην ανάπτυξη επιστημονικού λογισμικού. Τα ερευνητικά μου ενδιαφέροντα καλύπτουν επίσης τη θαλάσσια βιοακουστική, τα συστήματα παθητικής ακουστικής παρακολούθησης, και τη μέτρηση του υποβρύχιου περιβαλλοντικού θορύβου.

• Σε προπτυχιακό επίπεδο, διδάσκω τα μαθήματα Υδροακουστική Τεχνολογία, Ειδικά Κεφάλαια Βιοακουστικής και Θαλάσσια Θηλαστικά,  Αλιευτική Διαχείριση, και συμμετέχω στη διδασκαλία των εργαστηριακών ασκήσεων της Αλιευτικής Βιολογίας.
• Σε μεταπτυχιακό επίπεδο, συντονίζω το μάθημα Θαλάσσιοι Βιολογικοί Πόροι–Αλιεία και Υδατοκαλλιέργειες (συνδιδασκαλία με άλλα μέλη ΔΕΠ του Τμήματος), και συμμετέχω στη διδασκαλία της Εφαρμοσμένης Θαλάσσιας Οικολογίας.

• 2019–σήμερα: Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Ωκεανογραφίας και Θαλασσίων Βιοεπιστημών, Παν. Αιγαίου.
• 2015–2018: Διδάσκων (ΠΔ 407/1980), Τμήμα Ωκεανογραφίας και Θαλασσίων Βιοεπιστημών, Παν. Αιγαίου.
• 2012–2013: Υπότροφος ερευνητής, Harbor Branch Oceanographic Institute, Florida Atlantic University (USA).

Galanos V, Trygonis V, Mazaris AD, Katsanevakis S, (2025). A low-cost passive acoustic toolkit for underwater recordings. Sensors 25(23), 7306. doi: 10.3390/s25237306

Fuentes Rivera Escalante M, Galanos V, Trygonis V, (2025). The underwater noise footprint of bottom trawling in the National Marine Park of Alonnisos, Greece. Thalassas 41, 192. doi: 10.1007/s41208-025-00946-9

Brady B, Hedwig D, Trygonis V, Gerstein E, (2020). Classification of Florida manatee (Trichechus manatus latirostris) vocalizations. Journal of the Acoustical Society of America 147, 1597–1606. doi: 10.1121/10.0000849

Brehmer P, Sancho G, Trygonis V, Itano D, Dalen J, Fuchs A, Faraj A, Taquet M, (2019). Towards an autonomous pelagic observatory: experiences from monitoring fish communities around drifting FADs. Thalassas 35, 177–189. doi: 10.1007/s41208-018-0107-9

Trygonis V, Kapelonis Z, (2018). Corrections of fish school area and mean volume backscattering strength by simulation of an omnidirectional multi-beam sonar. ICES Journal of Marine Science 75, 1496–1508. doi: 10.1093/icesjms/fsy009

Dimitriadis C, Sini M, Trygonis V, Gerovasileiou V, Sourbés L, Koutsoubas D, (2018). Assessment of fish communities in a Mediterranean MPA: can a seasonally enforced no-take area provide effective protection? Estuarine, Coastal and Shelf Science 207, 223–231. doi: 10.1016/j.ecss.2018.04.012

Trygonis V, Georgakarakos S, Dagorn L, Brehmer P, (2016). Spatiotemporal distribution of fish schools around drifting fish aggregating devices. Fisheries Research 177, 39–49. doi: 10.1016/j.fishres.2016.01.013

Gerstein E, Trygonis V, McCulloch S, Moir J, Kraus S, (2014). Female North Atlantic right whales produce gunshot sounds. Journal of the Acoustical Society of America 135, 2369. doi: 10.1121/1.4877814

Trygonis V, Gerstein E, Moir J, McCulloch S, (2013). Vocalization characteristics of North Atlantic right whale surface active groups in the calving habitat, southeastern United States. Journal of the Acoustical Society of America 134, 4518−4531. doi: 10.1121/1.4824682

Gerovasileiou V, Trygonis V, Sini M, Koutsoubas D, Voultsiadou E, (2013). Three-dimensional mapping of marine caves using a handheld echosounder. Marine Ecology Progress Series 486, 13–22. doi: 10.3354/meps10374

Trygonis V, Sini M, (2012). photoQuad: a dedicated seabed image processing software, and a comparative error analysis of four photoquadrat methods. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 424-425, 99−108.  doi: 10.1016/j.jembe.2012.04.018

Trygonis V, Georgakarakos S, Simmonds EJ, (2009). An operational system for automatic school identification on multibeam sonar echoes. ICES Journal of Marine Science 66, 935−949. doi: 10.1093/icesjms/fsp135