• Θαλάσσια Βιοποικιλότητα (Tαξονομία, Zωογεωγραφία, Oικολογία Mεσογειακών Ασπονδύλων)
• Δομή, Δυναμική και Οικολογία Μακροβενθικών Βιοκοινοτήτων σε Παράκτια και Βαθύαλα Οικοσυστήματα
• Αλιευτική Βιολογία, Δυναμική Πληθυσμών και Διαχείριση Αποθεμάτων Θαλάσσιων Ασπονδύλων (Μαλάκια)
• Οικολογία και Pύπανση Παράκτιων και Μεταβατικών Οικοσυστημάτων
• Μελέτες Περιβαλλοντικών Επιπτώσεων (Pollution Assessment and Monitoring studies)
• Διαχείριση Παράκτιας Ζώνης
• Αλληλεπιδράσεις Ιχθυοκαλλιεργειών - Θαλάσσιου Περιβάλλοντος
• Αλλόχθονα Είδη και Κλιματική αλλαγή
• Θαλάσσιες Προστατευόμενες Περιοχές
• Καταδυτικός Τουρισμός
• Περιβαλλοντική Εκπαίδευση

Προπτυχιακά Μαθήματα: (διαλέξεις, φροντιστήρια, εργαστήρια): Θαλάσσια Βιολογία, Θαλάσσια Οικολογία, Παράκτια και Μεταβατικά Οικοσυστήματα, Θαλάσσια Βιοποικιλότητα.

Μεταπτυχιακά Μαθήματα: (διαλέξεις, φροντιστήρια, εργαστήρια): Οικολογία Παρακτίων Οικοσυστημάτων, Διεθνείς και Ευρωπαϊκές Πολιτικές και Πρακτικές για την Ολοκληρωμένη Διαχείριση Παράκτιας Ζώνης.

Ως μέλος της Ερευνητικής Ομάδας "Θαλάσσιοι Βιολογικοί Πόροι και Διαχείριση Οικοσυστημάτων" και στο πλαίσιο των ακαδημαϊκών μου καθηκόντων, λαμβάνω μέρος σε Εφαρμοσμένα Εθνικά και Ευρωπαϊκά Ερευνητικά Προγράμματα (π.χ. MAST & MTP - CINCS, MATER; FAIR - CEPHVAR; LIFE-NATURE; CFP-STUDIES - CEPHACES; INTERREG IIIB CADSES - TWReferenceNET; 5o και 6o Πλαίσιο Έρευνας ΕΕ - AQCESS, CEPHSTOCK, ECOSUMMER; INTERREG HELLAS-CYPRUS, ΗΡΑΚΛΕΙΤΟΣ Ι & ΙΙ; ΠΥΘΑΓΟΡΑΣ ΙΙ, ESFRI - Lifewatch, ΕΠΠΕΡΑΑ «Περιβάλλον & Αειφόρος Ανάπτυξη») σχετικών με την την θαλάσσια βιοποικιλότητα και την εκτίμηση της οικολογικής κατάστασης στο θαλάσσιο περιβάλλον, την βιολογία, δυναμική πληθυσμών και την διαχείριση πληθυσμών θαλάσσιων ασπονδύλων με εμπορικό ενδιαφέρον στις Ευρωπαϊκές θάλασσες, την προστασία και διατήρηση απειλούμενων ειδών και οικοτόπων προτεραιότητας στα παράκτια οικοσυστήματα της Μεσογείου, τις αλληλεπιδράσεις Υδατοκαλλεργειών και θαλάσσιου περιβάλλοντος, τις Θαλάσσιες Προστατευόμενες Περιοχές, τα Αλλόχθονα Είδη και την Περιβαλλοντική Εκπαίδευση. Πρόεδρος του Δ.Σ. του Φορέα Διαχείρισης του Εθνικού Θαλάσσιου Πάρκου Ζακύνθου και Μέλος της Επιστημονικής Επιτροπής του Δικτύου Θαλάσσιων Προστατευομένων Περιοχών της Μεσογείου MedPAN ως Εθνικός Εκπρόσωπος (www.medpan.org).

Micheli F., Levin N., Giakoumi S., Katsanevakis S., Abdulla A., Coll M., Fraschetti S., Kark S., Koutsoubas D., Mackelworth P., Maiorano L. & H.P. Possingham, 2013. Setting priorities for regional conservation planning in the Mediterranean Sea. PLoS ONE, 8(4): e59038, 1-17.

Schofield G., Scott R., Dimadi A., Fossette S., Katselidis K., Koutsoubas D., Lilley M., Pantis J., Karagouni A. & G. Hays, 2013. Evidence-based marine protected area planning for a highly mobile endangered marine vertebrate. Biological Conservation, 161, 101-109.

Dimitriadis CH., Evagelopoulos Α. & D. Koutsoubas, 2012. Functional diversity and redundancy of soft bottom communities in brackish waters areas: local vs regional effects. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 426-427, 53-59.

Evagelopoulos Α., D. Koutsoubas, Basset A., Pinna M., Dimitriadis Ch., Sangiorgio F., Barbone E., Maidanou M., Koulouri P. & C. Dounas 2008. Spatial and seasonal variability of the macrobenthic fauna in Mediterranean solar salt-works ecosystems. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 18, S118-S134.

Karakassis I., Machias A., Pitta P., Papadopoulou K.N., Smith C.J., Apostolaki E.T., Giannoulaki M., Koutsoubas D. & S. Somarakis, 2006. Cross-community congruence of patterns in a marine ecosystem: do the parts reflect the whole? Marine Ecology Progress Series, 310, 47-54.