Θαλάσσια Βιοποικιλότητα και Διαχείριση Οικοσυστημάτων
Ερευνητικά προϊόντα
σε αυτήν τη σελίδα: photoQuad | CIMPAL | cavetopo
Εκτός από τις επιστημονικές δημοσιεύσεις και τεχνικές εκθέσεις των ερευνητικών προγραμμάτων, το Εργαστήριο αναπτύσσει μεθοδολογικά εργαλεία και επιστημονικά λογισμικά που είναι διαθέσιμα στη διεθνή επιστημονική κοινότητα.
photoQuad
Βιβλιογραφική
αναφορά
Trygonis V, Sini M, 2012. photoQuad: A dedicated seabed image processing software, and a comparative error analysis of four photoquadrat methods. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 424-425, 99–108. doi: 10.1016/j.jembe.2012.04.018
Το photoQuad είναι λογισμικό ποσοτικής επεξεργασίας φωτογραφικών δειγμάτων πλαισίου (photo quadrats) βενθικών βιοκοινοτήτων σκληρού υποστρώματος. Προσφέρει πολλαπλές μεθόδους ανάλυσης όπως καταμέτρηση ειδών, ανάλυση σε κελιά, τυχαία σημεία, χειροκίνητη ιχνηλάτηση περιγράμματος, και αυτόματη κατάτμηση εικόνας σε πολλαπλές κλίμακες, όπου κάθε μέθοδος εκτελείται σε διαφορετική στρώση (layer).
Το photoQuad διανέμεται δωρεάν: www.mar.aegean.gr/sonarlab/photoquad
Δείκτης CIMPAL
Βιβλιογραφική
αναφορά
Katsanevakis S, Tempera F, Teixeira H, 2016. Mapping the impact of alien species on marine ecosystems: The Mediterranean Sea case study. Diversity and Distributions 22, 694–707. doi: 10.1111/ddi.12429
Ο δείκτης CIMPAL αναπτύχθηκε για την εκτίμηση και χαρτογραφική αποτύπωση των σωρευτικών επιπτώσεων των εισβολικών ξενικών ειδών στα θαλάσσια οικοσυστήματα. Για τον υπολογισμό του CIMPAL συνεκτιμάται η κατανομή των θαλάσσιων οικοτόπων, η κατανομή των ξενικών ειδών και οι τεκμηριωμένες επιπτώσεις του κάθε ξενικού είδους στον κάθε οικότοπο. Ο CIMPAL δίνει τη δυνατότητα προτεραιοποίησης περιοχών, εισβολικών μονοπατιών και ειδών για λήψη διαχειριστικών μέτρων.
cavetopo
Βιβλιογραφική
αναφορά
Gerovasileiou V, Trygonis V, Sini M, Koutsoubas D, Voultsiadou E, 2013. Three-dimensional mapping of marine caves using a handheld echosounder. Marine Ecology Progress Series 486, 13–22. doi: 10.3354/meps10374
Σε συνεργασία με το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, το Εργαστήριό μας ανέπτυξε μια μέθοδο γρήγορης και τρισδιάστατης χαρτογράφησης υποβρύχιων σπηλαίων με χρήση ηχοβολιστικού χειρός. Το cavetopo είναι λογισμικό ανοικτού κώδικα που υλοποιεί αυτήν τη μέθοδο: εκτελείται σε περιβάλλον MATLAB από τη γραμμή εντολών, δέχεται ως είσοδο ένα αρχείο Excel με τις τοπογραφικές αποτυπώσεις, και εκτελεί αυτόματα τους γεωμετρικούς μετασχηματισμούς των δεδομένων, παράγοντας διαδραστικές τρισδιάστατες εικόνες του υποβρύχιου σπηλαίου.
Το cavetopo διανέμεται δωρεάν ως συμπληρωματικό υλικό της δημοσίευσης: doi: 10.3354/meps10374