Η ερευνητική ομάδα βρίσκεται σε συνεργασία και προσφέρει υπηρεσίες σε διάφορους δημόσιους αλλά και ιδιωτικούς φορείς όπως η Περιφέρεια Βορείου Αιγαίου, η Αποκεντρωμένη Διοίκηση Κρήτης, η Περιφέρεια Ιονίων Νήσων, ο Δήμος Μυτιλήνης, ο Δήμος Ρεθύμνου, ο Φορέας Διαχείρισης του Εθνικού Θαλάσσιου Πάρκου Ζακύνθου, το Τμήμα Υδάτων (Κύπρος), οι εταιρείες Akti Engineering, Paralia Srl (Cyprus), Atlantis (Cyprus) κ.α. Επιστημονικοί φορείς και ινστιτούτα-ιδρύματα με τα οποία υπάρχει στενή συνεργασία είναι τα ΕΚΠΑ, ΑΠΘ, ΕΜΠ, ΠΚ, ΤΕΙ Αθήνας, ΕΛΚΕΘΕ, ΙΤΕ, ΤΕΠΑΚ (Cyprus), Centre of Hydrology (UK), Free University of Berlin, ALTERRA, JRC, UNEP-DEWA, UNEP-GRID, UNEP-MAP, UNECE, τα Universities of Southampton, East Anglia και Aberdeen (UK), University of Geneva, University of the Basque Country κα. Επιπλέον, η ομάδα συμμετέχει σε σημαντικό αριθμό ερευνητικών προγραμμάτων που χρηματοδοτούνται από την Ευρωπαϊκή Ένωση.